1. 重大植物有害生物監測調查、診斷諮詢服務及防治
全面監測國內重大植物有害生物（東方果實蠅、瓜實蠅、斜紋夜蛾、水稻稻熱病、白葉枯病、二化螟、褐飛蝨、瘤野螟及洋香瓜病毒等）並進行預測分析及辦理作物病蟲害診斷諮詢服務，即時將監測登錄植物疫情管理資訊網，有效掌握國內重大植物有害生物疫情，進一步掌握地方上農作物病蟲害發生動態及為害情形，適時發出預警提醒農友提早做好防治。
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水稻稻熱病發生於葉鞘上的病徵
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設置性費洛蒙陷阱捕捉水稻二化螟，
監測害蟲數量及密度
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2. 強化植物有害生物防範措施
主要針對加入WTO後，因開放國外農產品進口且其進口量顯著增加而導致農民損失農產品，從兩方面予以救助，一方面針對減低外來有害生物之傳入風險，以及因有害生物於國內立足後衍生之危害問題，另方面針對受損產業加強國內重大疫病蟲害防疫及建立符合國際規範之防疫措施，改善生產體質，以達到加強防疫措施之面向，保護國內農業生產安全及維護我國為疫病蟲害非疫區或低流行區之目標。
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檢驗水草場水草害蟲採樣作業
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農田野鼠監測前鼠籠準備作業及設置示範
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3. 農藥管理及品質管制
（1） 市售農藥品質管制：全年抽查市售農藥成品，檢驗其有效成分極重要理化性質，並追蹤管制及輔導廠商改進，以防止其危害。
（2） 加強農藥販賣業者之管理：辦理農藥販賣業者執照核發及變更登記、檢查農藥販賣業者、加強劇毒性成品農藥販售檢查，落實劇毒性成品農藥販售登記。
（3） 農藥販賣業者訓練：辦理農藥販賣業者複訓講習，以利農藥政令宣導及提供農藥新知，藉以協助指導農民安全使用農藥。
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抽查劇毒性農藥
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農藥販賣業者訓練講習
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