宜蘭縣位於台灣東北部，東面緊鄰浩瀚的太平洋，三面環山水資源充沛，目前縣內香魚及鱘龍魚等水產動物養殖數量佔全台產量大宗，為服務本縣水產養殖農民，本所提供水產動物之防檢疫服務有水質檢驗、水產動物疾病診斷 （細菌分離培養鑑定、藥物敏感性試驗及用藥停藥期諮詢、協助病材後送與病毒分離培養鑑定），另為協助水產品之外銷，對提出申請之養殖場進行定期採樣
監測，縮短產品外銷檢疫所需時間，提高國際競爭力。
本所每年不定期邀請各水產專家，舉辦水產動物養殖農民教育訓練，提供養殖戶最新的防疫資訊，於訪視時向養殖戶宣導正確的防疫觀念，當養殖水產動物異常時應於第一時間送檢，以免延誤診斷及治療之最佳時機，尤其必須遵守『水產動物用藥品使用規範』用藥，準確投藥並嚴守停藥期及建立自衛防疫觀念，避免疫病相互傳染，期使業者養殖能成功獲利。